Rokujou Miharu verfügt über die Fähigkeit des 'Hijustu' (eine verborgene Technik), die in seinem Inneren lebt. Sehr viele Ninja wollen es lernen, weil derjenige, der diese Macht besitzt, der Gebieter der Welt der Ninja ist. Dieses Hijustu ist die Kraft der Schöpfung. Rokujous Klassenkamerad hat einen Klub Namens Nindou (Weg eines Ninja) gegründet. Diese Gruppe gründete er zusammen mit seinem Englischlehrer Kumohira. Kouichi und Kumohira sind geheime Ninjas. Sie versuchen Rokujou zu überreden. Als er von einen Gruppe Ninjas angegriffen wurde, welche das Hijustu wollten, ist er dieser Gruppe beigetreten. Sein Ziel ist der Gebieter von Nabari zu werden, ob er es wirklich schafft?